76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0983 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  100 
 
 
264 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  90.91 
 
 
264 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  90.53 
 
 
264 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  80.68 
 
 
277 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  48.85 
 
 
262 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  48.47 
 
 
262 aa  249  4e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  45.8 
 
 
262 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  45.8 
 
 
262 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  45.8 
 
 
260 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  43.35 
 
 
260 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  43.3 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  43.3 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  40.77 
 
 
259 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  47.71 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  42.21 
 
 
260 aa  213  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  39.69 
 
 
260 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  39.16 
 
 
260 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  43.13 
 
 
260 aa  201  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  42.31 
 
 
259 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  36.15 
 
 
262 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  30.15 
 
 
262 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  31.32 
 
 
262 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  30.3 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  26.72 
 
 
262 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  30.15 
 
 
262 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  30.3 
 
 
262 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  23.81 
 
 
261 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  27.72 
 
 
261 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  27.97 
 
 
262 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  27.24 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  26.14 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  28.73 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  20.97 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  22.43 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  22.05 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  19.92 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  22.37 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  20.52 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  21.51 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  22.93 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  22.68 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  21.27 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  24.42 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  22.01 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  20.23 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  20.53 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.02 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  20.23 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  20.53 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  20.53 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  20.53 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  20.53 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  22.01 
 
 
261 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  20.53 
 
 
261 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  22.14 
 
 
281 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0913  protein of unknown function DUF990  21.3 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  24.18 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  23.86 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  20.99 
 
 
278 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  19.91 
 
 
262 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  21.18 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  21.85 
 
 
265 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  19.85 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  20.38 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  24.88 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  21.79 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  21.3 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  19.62 
 
 
288 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  23.88 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  19.75 
 
 
269 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  20.9 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  18.14 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  18.14 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  17.61 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  25 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>