85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1187 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  46.32 
 
 		 272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  25.78 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  27.35 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  25.23 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  25.55 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  25.48 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  25.55 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  24.12 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  24.08 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  25.48 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  25.48 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  25.48 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  25.48 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  25.48 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  25.48 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  24.23 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  27.69 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  22.68 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  26.7 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  27.66 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  27.31 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  24.77 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  25.97 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  24.74 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  21.76 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  24.74 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  26.78 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  23.27 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  28.41 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  23.56 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3449  hypothetical protein  28.35 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  22.99 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.27 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  25.63 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  26.06 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  25.52 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  20.91 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  23.53 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  21.81 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  26.34 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  23.68 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  32.43 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  25 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  22.78 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  25.56 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  21.97 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  25.98 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.74 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  24.41 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  26.4 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  26.02 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  24.06 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2513  protein of unknown function DUF990  25.64 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000318044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  26.61 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  23.5 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  23.65 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  25.5 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  26.23 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  26.82 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  26.23 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  24.43 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29111  putative multidrug efflux ABC transporter  29.31 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  21.97 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  25.31 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  26.37 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  21.49 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  24.89 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  25.26 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  25.19 
 
 		 263 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  25.19 
 
 		 263 aa  49.3  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  23.88 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  20.22 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  20.44 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  25.68 
 
 		 262 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  20.94 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  25.34 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  27.72 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  24.52 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  26.35 
 
 		 267 aa  42.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>