63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3438 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  100 
 
 		 257 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  56.59 
 
 		 262 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  52.96 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  47.19 
 
 		 311 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  47.27 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  46.33 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  43.53 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  40.23 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  39.62 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  44.31 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  37.16 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  37.93 
 
 		 265 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  34.85 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  30.71 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  28.46 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  25.77 
 
 		 262 aa  99  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  27.03 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  27.03 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  27.03 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  27.57 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  27.03 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  29.19 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  28.84 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  26.49 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  28.63 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  29.73 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  24.62 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  24.52 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  25.95 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  27.23 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  24.25 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  27.82 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  20.72 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  24.03 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  24.03 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  26.05 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  23.6 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  27.87 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  27.87 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  26.74 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  19.92 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  27.7 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  23.7 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  23.65 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  26.62 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  26.92 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0137  protein of unknown function DUF990  22.77 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  25.55 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  21.39 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.28 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  26.13 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1506  protein of unknown function DUF990  21.16 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  24.66 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  23.4 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1129  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  19.93 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000681549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  24.3 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  24.14 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>