46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5808 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  100 
 
 		 289 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  77.54 
 
 		 279 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  74.09 
 
 		 278 aa  346  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4688  putative ABC transporter permease protein  72.92 
 
 		 280 aa  329  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  32.08 
 
 		 258 aa  135  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  30.8 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  26.98 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  28.32 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  29.62 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  27.07 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  28.41 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.65 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  33.21 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  27.63 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  24.82 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  28.89 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.5 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  29.07 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  24.82 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  24.82 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  24.82 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  24.82 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  24.82 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  24.82 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  24.82 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  24.82 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  25.36 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  23.24 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  30.18 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  24.45 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  29.63 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  29.63 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  32.57 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  24.45 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  26.57 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  26.67 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  25.89 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  28.03 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  28.33 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  32.73 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  20.68 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  23.91 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  28.7 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  22.91 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  23.12 
 
 		 266 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>