85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2387 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  100 
 
 
295 aa  574  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  52.96 
 
 
257 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  50.76 
 
 
262 aa  235  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  47.17 
 
 
266 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  41.35 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  41.31 
 
 
273 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  38.11 
 
 
311 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.85 
 
 
264 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  37.88 
 
 
261 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  36.12 
 
 
264 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  37.26 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  41.6 
 
 
264 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  25.67 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  31.3 
 
 
284 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  30.6 
 
 
267 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  28.25 
 
 
270 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  23.57 
 
 
263 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  26.98 
 
 
258 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  23.95 
 
 
263 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  23.57 
 
 
263 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  23.57 
 
 
263 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  23.57 
 
 
263 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  23.57 
 
 
263 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  23.57 
 
 
263 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  23.57 
 
 
263 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  23.19 
 
 
263 aa  99  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  23.64 
 
 
259 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  25.1 
 
 
263 aa  95.5  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  26.69 
 
 
263 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  30.08 
 
 
259 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  24.05 
 
 
268 aa  92.4  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  24.9 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  23.57 
 
 
263 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  23.97 
 
 
267 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  27.61 
 
 
266 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  26.61 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  24.23 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  26.67 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  27.76 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  20.82 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  20.82 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  23.56 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  28.41 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  21.88 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  25.58 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  25.82 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  22.35 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  27.1 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  25.61 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  24.48 
 
 
263 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  24.48 
 
 
263 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  21.43 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  26.92 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4688  putative ABC transporter permease protein  27.94 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  22.69 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  20.37 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  26.19 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  26.2 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  26.2 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  27.95 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  23.6 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  27.61 
 
 
268 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  26.05 
 
 
268 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  27.2 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  24.63 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  23.53 
 
 
263 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  26.32 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  23.53 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  26.58 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.1 
 
 
262 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  24.37 
 
 
264 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  24.08 
 
 
262 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  26.91 
 
 
265 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  26.13 
 
 
265 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  25.21 
 
 
264 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1129  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  24.72 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000681549  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0137  protein of unknown function DUF990  18.11 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  25.25 
 
 
263 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  25.1 
 
 
265 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  26.09 
 
 
272 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3449  hypothetical protein  35.44 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  31.82 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  20.82 
 
 
273 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  20.82 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  24.11 
 
 
280 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>