74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1965 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  100 
 
 
257 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  74.32 
 
 
257 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  30.83 
 
 
267 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  31.7 
 
 
262 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  32.46 
 
 
262 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  28.63 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  31.58 
 
 
265 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  31.56 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  31.2 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  30.08 
 
 
262 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  29.32 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  32.03 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  31.2 
 
 
265 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  29.72 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  27.07 
 
 
264 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  26.92 
 
 
264 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  26.92 
 
 
264 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  29.09 
 
 
273 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  29.09 
 
 
273 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  26.54 
 
 
263 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2513  protein of unknown function DUF990  32.71 
 
 
262 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000318044  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  27.45 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  27.76 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  27.45 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  28.24 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  27.84 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29111  putative multidrug efflux ABC transporter  26.95 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3449  hypothetical protein  27.95 
 
 
262 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  24.25 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  24.62 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  31.25 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  21.29 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  26.7 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  24.41 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  24.63 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  26.01 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  24.72 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  24.72 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  24.31 
 
 
286 aa  62.4  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  20.23 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  21.43 
 
 
272 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  22.52 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  21.05 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  21.74 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  22.88 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  23.6 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  24.34 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  24.18 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  27.03 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  22.06 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  22.06 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  22.06 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  22.06 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  22.06 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  20.32 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  24.06 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  20.6 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  23.02 
 
 
299 aa  49.3  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  21.69 
 
 
263 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  21.69 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  21.69 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.79 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  21.69 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  25.34 
 
 
311 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  26.53 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  21.97 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  25.77 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  26.23 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  25.37 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  21.74 
 
 
266 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  22.18 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  22.18 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  27.6 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  22.84 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>