64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0982 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  100 
 
 
264 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  95.45 
 
 
264 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  96.21 
 
 
264 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  84.29 
 
 
263 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  59.14 
 
 
265 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  59.14 
 
 
265 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  53.85 
 
 
265 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  53.08 
 
 
265 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29111  putative multidrug efflux ABC transporter  49.43 
 
 
265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  43.19 
 
 
262 aa  231  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  40.08 
 
 
262 aa  224  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  38.93 
 
 
273 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  38.93 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  38.22 
 
 
261 aa  214  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  42.41 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  41.25 
 
 
259 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  37.16 
 
 
262 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  36.76 
 
 
262 aa  185  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3449  hypothetical protein  38.87 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2513  protein of unknown function DUF990  30.8 
 
 
262 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000318044  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  26.69 
 
 
257 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  25.84 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  26.42 
 
 
267 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  25.38 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  25 
 
 
265 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  25.21 
 
 
265 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  26.37 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  21.92 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  21.29 
 
 
268 aa  72  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  25.86 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  21.46 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  25.94 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  24.16 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.08 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  21.67 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  25.21 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  20.77 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  22.76 
 
 
299 aa  52.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  22.27 
 
 
268 aa  52.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  25.54 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  24.81 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  22.87 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  24.04 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1506  protein of unknown function DUF990  27.01 
 
 
254 aa  47  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  25.42 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  29.67 
 
 
251 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  25.09 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  23.33 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  25.46 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  22.55 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  22.4 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  24.72 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  24.72 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  24.63 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  24.72 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  24.72 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  24.72 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  24.72 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  24.72 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  24.72 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.7 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.7 
 
 
256 aa  42.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 
253 aa  42  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 
253 aa  42  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>