60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2210 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  100 
 
 		 265 aa  511  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  94.72 
 
 		 265 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  65.28 
 
 		 265 aa  362  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  65.28 
 
 		 265 aa  362  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29111  putative multidrug efflux ABC transporter  71.7 
 
 		 265 aa  358  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  53.99 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  53.08 
 
 		 264 aa  298  5e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  53.08 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  52.47 
 
 		 264 aa  294  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  47.89 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  47.83 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  45.25 
 
 		 273 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  45.25 
 
 		 273 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  49.81 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  47.49 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  45.91 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  44.27 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  45.8 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3449  hypothetical protein  42.41 
 
 		 262 aa  184  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2513  protein of unknown function DUF990  40.08 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000318044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  29.2 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  28.24 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  31.95 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  30.34 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  29.5 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  31.85 
 
 		 265 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  31.32 
 
 		 265 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  29.72 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  24.34 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  28.03 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  24.4 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  26.84 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  28.77 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  34.45 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  25.59 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  22.39 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  21.97 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  27.27 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  23.51 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  23.18 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  26.89 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  21.79 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.86 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  26.97 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  25 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  23.65 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  35.05 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.08 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  21.61 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  21.61 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  25.56 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  21.61 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  21.61 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  21.61 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  21.61 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  21.61 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  21.61 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  21.25 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  26.19 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  26.81 
 
 		 251 aa  42  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>