69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1922 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  47.19 
 
 
257 aa  205  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  45.69 
 
 
262 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  38.11 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  41.39 
 
 
266 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  35.66 
 
 
261 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.43 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  37.59 
 
 
265 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  35.74 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.19 
 
 
264 aa  125  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  27.41 
 
 
262 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  37.97 
 
 
264 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  30.21 
 
 
267 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  26.1 
 
 
270 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  23.16 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  28.18 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  22.01 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  24.9 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  26.89 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  24.75 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  24.52 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  24.75 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  24.75 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  24.75 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  25.25 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  26.89 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  24.75 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  24.75 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  24.75 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  24.75 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  24.75 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  27.41 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  25.25 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  24.63 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  28.65 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  19.22 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  19.22 
 
 
272 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  31.63 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  31.63 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  22.78 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  27.4 
 
 
272 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  24.24 
 
 
263 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  25.12 
 
 
284 aa  62.4  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  24.75 
 
 
263 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  33.58 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  21.32 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  28.35 
 
 
257 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  19.35 
 
 
268 aa  56.6  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  24.86 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  24.37 
 
 
257 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  27.03 
 
 
268 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.53 
 
 
262 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  23.39 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  23.81 
 
 
268 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  23.16 
 
 
263 aa  49.7  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  25.93 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  25.93 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  35.29 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  26.47 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  28.7 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0137  protein of unknown function DUF990  19.25 
 
 
254 aa  46.2  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  30.93 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1506  protein of unknown function DUF990  16.42 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346174  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  22.87 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  30 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  28.63 
 
 
259 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  30.14 
 
 
262 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  33.02 
 
 
272 aa  42.4  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>