47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4688 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4688  putative ABC transporter permease protein  100 
 
 		 280 aa  534  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  74.01 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  73.21 
 
 		 279 aa  359  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  70.71 
 
 		 278 aa  332  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  35.71 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  33.82 
 
 		 267 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  28.67 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  27.02 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  29.5 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.46 
 
 		 264 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  29.41 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  32.13 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.7 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  26.28 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  31.21 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  27.56 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  29.43 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  28.14 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  24.91 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  24.91 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  23.68 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  24.91 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  24.91 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  24.91 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  31.05 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  25.76 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  28.21 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  28.21 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  29.18 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  23.27 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  22.38 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  31.27 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  22.65 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  23.48 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  22.3 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  25.51 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  24.87 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  25.93 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  20 
 
 		 268 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  21.78 
 
 		 251 aa  49.7  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  29.65 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  21.52 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  22.22 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>