16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0436 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0436  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 254 aa  499  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0524  hypothetical protein  34.82 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000443046 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0229  hypothetical protein  32.51 
 
 		 250 aa  95.1  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0141288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21540  ABC-type multidrug transport system, permease component  28 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.937683 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1603  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  25.34 
 
 		 369 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  29.69 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 		 372 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  26.67 
 
 		 369 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 		 371 aa  42.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  26.19 
 
 		 377 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>