28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0127 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0127  ABC-2 transporter component  100 
 
 		 282 aa  548  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177807  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2239  hypothetical protein  60.9 
 
 		 268 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.627796  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  47.92 
 
 		 276 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  48.08 
 
 		 276 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  45.86 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0577  ABC-2 type transporter  48.85 
 
 		 276 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7657  putative ABC transporter, permease protein  49.23 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0434  ABC-2 type transporter  42.91 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  35.91 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  36.29 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3285  ABC-2 type transporter  36.68 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2789  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 267 aa  118  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 365 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  25.18 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0525  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  36.17 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 		 376 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  30.14 
 
 		 371 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  23.02 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  41.03 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  25.56 
 
 		 365 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>