31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1446 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1446  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 422 aa  811    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.145577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  21.6 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  21.6 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 336 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 		 358 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  19.07 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.81 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  18.55 
 
 		 381 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  20.29 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  22.47 
 
 		 365 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  22.41 
 
 		 341 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 366 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  27.6 
 
 		 327 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  20.49 
 
 		 339 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  21.91 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  23.84 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  24.04 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 269 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  20.16 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10720  hypothetical protein  25.76 
 
 		 384 aa  43.9  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 374 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>