17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10720 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10720  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  789    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0562  hypothetical protein  33.41 
 
 
406 aa  208  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0638  multidrug ABC transporter permease  29.78 
 
 
412 aa  192  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.490558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1224  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1308  hypothetical protein  21.94 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1640  multidrug ABC transporter, permease  21.56 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000347744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1662  ABC transporter permease  22.22 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1794  ABC transporter permease  22.22 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1609  multidrug ABC transporter, permease  21.59 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1866  ABC transporter, permease protein  20.42 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1916  ABC transporter, permease protein  20.79 
 
 
369 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1659  ABC-2 type transporter  19.95 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0599997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1842  ABC transporter, permease protein  20.92 
 
 
346 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.737626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1805  ABC transporter, permease protein  19.37 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3535  ABC transporter, permease protein  19.9 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  22.48 
 
 
367 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0695  hypothetical protein  20.2 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>