39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2899 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2899  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  810    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0941072  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  20.34 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4687  ABC-2 type transporter  21.51 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.696171  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1150  ABC-2 type transporter  21.01 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.13202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  24.31 
 
 		 428 aa  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  21.2 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  21.29 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  19.89 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  20.18 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2362  ABC-2 type transporter  20.22 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0759041  normal  0.863187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1496  ABC-2 type transporter  20.22 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.679397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  19.73 
 
 		 373 aa  46.6  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  26 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  23.17 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  18.41 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.51 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  27.84 
 
 		 935 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6205  ABC-2 type transporter  21.16 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.261883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  20.78 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  21.29 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3659  putative ABC transporter (permease protein)  22.4 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00759514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  19.88 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  20.43 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3789  ABC-2 type transporter  21.33 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  20.43 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5884  ABC-2 type transporter  21.16 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0626  ABC-2 type transporter  22.43 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  20.29 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  20.29 
 
 		 368 aa  43.1  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  20.29 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  20.29 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  20.29 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  20.29 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  20.29 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  20.29 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  20.29 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>