More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1150 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1150  ABC-2 type transporter  100 
 
 
412 aa  823    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.13202  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  62.97 
 
 
374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  62.97 
 
 
374 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  62.97 
 
 
374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3897  ABC transporter ATP-binding protein  62.97 
 
 
374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2362  ABC-2 type transporter  59.57 
 
 
382 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0759041  normal  0.863187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  63.04 
 
 
373 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 
374 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  61.73 
 
 
374 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  61.73 
 
 
374 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  61.46 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  61.46 
 
 
374 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  61.46 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  61.73 
 
 
374 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  61.73 
 
 
374 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1496  ABC-2 type transporter  59.3 
 
 
382 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.679397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  61.46 
 
 
374 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  58.29 
 
 
376 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  61.73 
 
 
374 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  61.08 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  61.35 
 
 
374 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  59.51 
 
 
373 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2685  hypothetical protein  60.6 
 
 
373 aa  428  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1683  multidrug ABC transporter permease component  56.85 
 
 
397 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0017586  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4914  ABC-2 type transporter  60.5 
 
 
370 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  58.27 
 
 
372 aa  428  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  59.89 
 
 
376 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4687  ABC-2 type transporter  60.93 
 
 
370 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.696171  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2181  ABC-2 type transporter  60.65 
 
 
374 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64312  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  59.57 
 
 
374 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2341  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  58.22 
 
 
374 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612393  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0171  hypothetical protein  59.57 
 
 
375 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1349  ABC transporter, permease protein, putative  58.63 
 
 
370 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0626  ABC-2 type transporter  60.11 
 
 
373 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1825  ABC-2 type transporter  58.36 
 
 
370 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0526143  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1307  putative ABC transporter, permease protein  58.08 
 
 
370 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0315  ABC-2 type transporter  61.35 
 
 
374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  58.47 
 
 
371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3418  ABC-2 type transporter  58.15 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1431  hypothetical protein  60.11 
 
 
371 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  56.01 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  55.74 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3576  hypothetical protein  57.3 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3659  putative ABC transporter (permease protein)  58.84 
 
 
370 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00759514  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  55.74 
 
 
374 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  55.74 
 
 
374 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  55.74 
 
 
374 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  55.74 
 
 
374 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  55.74 
 
 
374 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  51.5 
 
 
375 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6205  ABC-2 type transporter  57.92 
 
 
374 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.261883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4663  hypothetical protein  59.29 
 
 
370 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5884  ABC-2 type transporter  59.02 
 
 
374 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  53.23 
 
 
374 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  51.65 
 
 
376 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  51.75 
 
 
373 aa  363  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  53.01 
 
 
373 aa  361  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  47.81 
 
 
374 aa  358  7e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  51.51 
 
 
375 aa  356  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  48.25 
 
 
370 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  48.4 
 
 
370 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2949  ABC-2 type transporter  50.7 
 
 
382 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  48.14 
 
 
370 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  49.18 
 
 
379 aa  347  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  47.95 
 
 
393 aa  345  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  47.84 
 
 
399 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  47.84 
 
 
399 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1613  ABC-2 type transporter  47.27 
 
 
374 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  46.22 
 
 
375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3789  ABC-2 type transporter  46.13 
 
 
390 aa  338  9e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5443  hypothetical protein  47.38 
 
 
372 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0537  ABC-2 type transporter  47.03 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0080  ABC-2 type transporter  48.88 
 
 
379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0879828  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  45.9 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5749  ABC-2 type transporter  46.36 
 
 
375 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166668  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3879  ABC transporter  48.56 
 
 
350 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 
401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3215  hypothetical protein  41.58 
 
 
374 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  40.22 
 
 
374 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  39.67 
 
 
374 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  30.5 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 
376 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  32.91 
 
 
370 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 
377 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  28.2 
 
 
368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 
372 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 
379 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 
378 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  27.99 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.5 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  31.12 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.03 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  26.03 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  26.03 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  26.03 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  26.03 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>