More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3215 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3215  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  83.42 
 
 		 374 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  83.96 
 
 		 374 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  47.55 
 
 		 401 aa  356  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3789  ABC-2 type transporter  48.64 
 
 		 390 aa  349  4e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  48.09 
 
 		 399 aa  347  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  48.09 
 
 		 399 aa  347  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0537  ABC-2 type transporter  47.27 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  45.95 
 
 		 375 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2362  ABC-2 type transporter  43.51 
 
 		 382 aa  305  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0759041  normal  0.863187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1496  ABC-2 type transporter  43.24 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.679397  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  42.2 
 
 		 373 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  42.51 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  42.16 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  42.97 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 374 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 374 aa  295  6e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  42.62 
 
 		 373 aa  295  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 374 aa  295  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.89 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  41.89 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  41.89 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  44.47 
 
 		 375 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5749  ABC-2 type transporter  40.43 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2685  hypothetical protein  43.17 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  42.59 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1349  ABC transporter, permease protein, putative  42.93 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  42.43 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  42.55 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  42.16 
 
 		 374 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1307  putative ABC transporter, permease protein  42.93 
 
 		 370 aa  289  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  42.55 
 
 		 370 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  42.28 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3897  ABC transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0080  ABC-2 type transporter  44.96 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0879828  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1150  ABC-2 type transporter  41.58 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.13202  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 		 374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2341  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  40.54 
 
 		 374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  40.6 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1825  ABC-2 type transporter  41.85 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0526143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  39.73 
 
 		 376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5443  hypothetical protein  41.67 
 
 		 372 aa  281  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889571 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  39.89 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4914  ABC-2 type transporter  41.53 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3418  ABC-2 type transporter  40.76 
 
 		 373 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2181  ABC-2 type transporter  39.57 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  42.78 
 
 		 376 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1613  ABC-2 type transporter  43.05 
 
 		 374 aa  278  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  41.03 
 
 		 371 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  41.13 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3659  putative ABC transporter (permease protein)  41.42 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00759514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0626  ABC-2 type transporter  42.01 
 
 		 373 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1683  multidrug ABC transporter permease component  39.62 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0017586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3576  hypothetical protein  39.07 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  41.08 
 
 		 374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  37.9 
 
 		 373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0171  hypothetical protein  41.18 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1431  hypothetical protein  41.8 
 
 		 371 aa  272  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  38.65 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  39.73 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  38.9 
 
 		 374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4687  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 370 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.696171  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  38.9 
 
 		 374 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  38.9 
 
 		 374 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  38.9 
 
 		 374 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 		 374 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.63 
 
 		 374 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  39.13 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  39.47 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6205  ABC-2 type transporter  41.19 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.261883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  39.3 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  37.2 
 
 		 374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4663  hypothetical protein  40.22 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3879  ABC transporter  40.63 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5884  ABC-2 type transporter  40.98 
 
 		 374 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2949  ABC-2 type transporter  40.22 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0315  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  26.89 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  28.3 
 
 		 368 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  28.03 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  28.03 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  28.03 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  28.03 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  27.22 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.76 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  27.76 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  27.76 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  27.76 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  27.76 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>