More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6205 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6205  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 374 aa  744    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.261883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5884  ABC-2 type transporter  93.32 
 
 		 374 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  78.02 
 
 		 374 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  77.75 
 
 		 374 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  78.02 
 
 		 374 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  77.75 
 
 		 374 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  78.02 
 
 		 374 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  78.02 
 
 		 374 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  77.75 
 
 		 374 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1496  ABC-2 type transporter  72.21 
 
 		 382 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.679397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2362  ABC-2 type transporter  72.21 
 
 		 382 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0759041  normal  0.863187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2341  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  74.53 
 
 		 374 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2181  ABC-2 type transporter  69.71 
 
 		 374 aa  512  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  73.02 
 
 		 376 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1683  multidrug ABC transporter permease component  69.97 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0017586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  68.9 
 
 		 374 aa  508  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  66.58 
 
 		 376 aa  508  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  67.3 
 
 		 373 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0171  hypothetical protein  66.31 
 
 		 375 aa  471  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2685  hypothetical protein  65.4 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  63.71 
 
 		 373 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1349  ABC transporter, permease protein, putative  65.48 
 
 		 370 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1307  putative ABC transporter, permease protein  64.93 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  64.08 
 
 		 374 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0626  ABC-2 type transporter  65.23 
 
 		 373 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  63.27 
 
 		 374 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1825  ABC-2 type transporter  64.66 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0526143  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  61.66 
 
 		 374 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  63.01 
 
 		 371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  61.39 
 
 		 374 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  61.66 
 
 		 374 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  61.39 
 
 		 374 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3897  ABC transporter ATP-binding protein  61.39 
 
 		 374 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4914  ABC-2 type transporter  63.56 
 
 		 370 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3418  ABC-2 type transporter  63.34 
 
 		 373 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  59.3 
 
 		 372 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  59.79 
 
 		 374 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  59.79 
 
 		 374 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  59.52 
 
 		 374 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  59.52 
 
 		 374 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  60.05 
 
 		 374 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  60.05 
 
 		 374 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  59.79 
 
 		 374 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  59.79 
 
 		 374 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  59.79 
 
 		 374 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4687  ABC-2 type transporter  61.48 
 
 		 370 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.696171  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3576  hypothetical protein  59.56 
 
 		 370 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4663  hypothetical protein  63.39 
 
 		 370 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3659  putative ABC transporter (permease protein)  61.22 
 
 		 370 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00759514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  55.34 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0315  ABC-2 type transporter  61.93 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  55.41 
 
 		 374 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1431  hypothetical protein  58.49 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1150  ABC-2 type transporter  57.26 
 
 		 412 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.13202  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  49.73 
 
 		 375 aa  363  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  53.12 
 
 		 373 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  51.65 
 
 		 376 aa  358  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  48.34 
 
 		 375 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3789  ABC-2 type transporter  49.73 
 
 		 390 aa  346  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2949  ABC-2 type transporter  50.82 
 
 		 382 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  49.73 
 
 		 375 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  48.38 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  48.39 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  48.12 
 
 		 370 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  48.79 
 
 		 379 aa  335  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  48.22 
 
 		 401 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  49.32 
 
 		 399 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5443  hypothetical protein  48.38 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  49.32 
 
 		 399 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0080  ABC-2 type transporter  49.86 
 
 		 379 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0879828  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  48.75 
 
 		 393 aa  328  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  44.74 
 
 		 374 aa  325  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0537  ABC-2 type transporter  48.22 
 
 		 398 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1613  ABC-2 type transporter  44.93 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  44.05 
 
 		 374 aa  318  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5749  ABC-2 type transporter  46.43 
 
 		 375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3879  ABC transporter  45.82 
 
 		 350 aa  299  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3215  hypothetical protein  41.19 
 
 		 374 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  42.12 
 
 		 374 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  41.85 
 
 		 374 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  32.08 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  31.41 
 
 		 377 aa  155  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  33.65 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 366 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  28.3 
 
 		 376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  27.79 
 
 		 375 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  28.87 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  29.82 
 
 		 376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  32.51 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  29.46 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  27.97 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  26.95 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 378 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>