55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2624 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2624  ABC-2 type transporter  100 
 
 
381 aa  761    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3535  ABC transporter, permease protein  28 
 
 
369 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1805  ABC transporter, permease protein  28.7 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1640  multidrug ABC transporter, permease  27.56 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000347744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1842  ABC transporter, permease protein  27.72 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.737626 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1794  ABC transporter permease  27.3 
 
 
369 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1866  ABC transporter, permease protein  27.11 
 
 
369 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1662  ABC transporter permease  27.3 
 
 
369 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1609  multidrug ABC transporter, permease  28.16 
 
 
369 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1916  ABC transporter, permease protein  28.99 
 
 
369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 
367 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1659  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 
369 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0599997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  22.75 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  22.02 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
241 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 
241 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
260 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  22.36 
 
 
381 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  23.2 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  21.59 
 
 
381 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  26.7 
 
 
357 aa  49.7  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0077  ABC-2 type transporter  25 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1224  ABC-2 type transporter  20.51 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  21.17 
 
 
377 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  20.86 
 
 
377 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  18.82 
 
 
381 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  24.41 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  29.01 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  21.21 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  22.19 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  22.19 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  25.81 
 
 
368 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  25.81 
 
 
368 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  25.81 
 
 
368 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  25.81 
 
 
368 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  25.81 
 
 
368 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  25 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  25 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  25 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  25 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  25 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  25 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  25 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  25 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  25 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  21.9 
 
 
381 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  21.9 
 
 
381 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 
368 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.86 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>