More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4952 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  100 
 
 		 522 aa  1009    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  63.23 
 
 		 245 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  60.09 
 
 		 245 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  59.73 
 
 		 251 aa  240  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.16 
 
 		 283 aa  221  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  54.3 
 
 		 247 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5570  ABC transporter related  56.19 
 
 		 239 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0010719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  56.74 
 
 		 249 aa  217  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 		 254 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  51.48 
 
 		 240 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  53.78 
 
 		 238 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2957  ABC transporter related  53.57 
 
 		 253 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3001  ABC transporter related  53.57 
 
 		 253 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2972  ABC transporter related  53.12 
 
 		 253 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  0.0110597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  46.75 
 
 		 245 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  52.77 
 
 		 289 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2393  ABC transporter related protein  57.6 
 
 		 243 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.56 
 
 		 243 aa  189  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  50.45 
 
 		 254 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  46.31 
 
 		 251 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  48.13 
 
 		 241 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11703  ATP-binding protein ABC transporter  51.36 
 
 		 255 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.228043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  41.59 
 
 		 244 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 242 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 241 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  49.17 
 
 		 251 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  51.17 
 
 		 252 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  46.86 
 
 		 247 aa  169  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 248 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  41.74 
 
 		 248 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 248 aa  167  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  40.85 
 
 		 308 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 		 222 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 		 222 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 248 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.99 
 
 		 308 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  35.48 
 
 		 241 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 241 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  46.7 
 
 		 226 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 		 241 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  43.06 
 
 		 335 aa  163  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.27 
 
 		 322 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 248 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.62 
 
 		 308 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 241 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 241 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  45.15 
 
 		 283 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.98 
 
 		 248 aa  160  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  42.38 
 
 		 304 aa  160  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  43.11 
 
 		 226 aa  160  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  43 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  38.21 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 		 930 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 		 321 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  39.06 
 
 		 915 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  43.26 
 
 		 328 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  44.39 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  42.38 
 
 		 318 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  33.33 
 
 		 913 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  33.33 
 
 		 913 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  33.33 
 
 		 913 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  33.33 
 
 		 913 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  42.38 
 
 		 318 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  43.27 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  43.27 
 
 		 346 aa  158  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  42.38 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 		 311 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  43.27 
 
 		 346 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  48.76 
 
 		 251 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  41.59 
 
 		 318 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0738  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.96 
 
 		 245 aa  157  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  39.61 
 
 		 315 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  46.7 
 
 		 226 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  46.7 
 
 		 226 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  41.67 
 
 		 326 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  37.34 
 
 		 255 aa  156  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  43.35 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  34.2 
 
 		 247 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  40.47 
 
 		 317 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  43.81 
 
 		 291 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  39.71 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  41.75 
 
 		 323 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  43 
 
 		 317 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  41.75 
 
 		 323 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  40.54 
 
 		 929 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  36.94 
 
 		 927 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.23 
 
 		 913 aa  153  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  41.55 
 
 		 326 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  37.68 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 		 323 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  42.03 
 
 		 354 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 305 aa  152  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  37.5 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  38.61 
 
 		 924 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  40 
 
 		 286 aa  151  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  42.11 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  41.85 
 
 		 307 aa  151  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  39.41 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  40.95 
 
 		 318 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>