More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11703 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11703  ATP-binding protein ABC transporter  100 
 
 
255 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.228043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2957  ABC transporter related  71.65 
 
 
253 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3001  ABC transporter related  71.65 
 
 
253 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2972  ABC transporter related  71.26 
 
 
253 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  0.0110597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  71.89 
 
 
254 aa  350  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  57.69 
 
 
245 aa  258  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  56.84 
 
 
245 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  54.78 
 
 
238 aa  255  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  55.33 
 
 
254 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  52.05 
 
 
251 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  53.25 
 
 
249 aa  234  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5570  ABC transporter related  56.28 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0010719  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2393  ABC transporter related protein  54.89 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.22 
 
 
283 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  50.61 
 
 
247 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  39.58 
 
 
242 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
248 aa  192  6e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  38.53 
 
 
241 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  44.14 
 
 
248 aa  185  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 
241 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  51.36 
 
 
522 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  38.86 
 
 
244 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
241 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  37.23 
 
 
248 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
241 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  38.32 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  38.32 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0738  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.73 
 
 
245 aa  171  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032696  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  38.22 
 
 
241 aa  170  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  41.38 
 
 
286 aa  169  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  45.45 
 
 
283 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.24 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  43.4 
 
 
299 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 
234 aa  164  9e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.71 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2550  ABC transporter related  43.06 
 
 
330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0766214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  41.07 
 
 
322 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 
308 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  32.44 
 
 
541 aa  161  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.57 
 
 
907 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0260  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 
238 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000146773  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  39.61 
 
 
340 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  37.12 
 
 
255 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  40.45 
 
 
325 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  38.06 
 
 
510 aa  158  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  37.3 
 
 
512 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  38.97 
 
 
318 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  38.97 
 
 
318 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  38.97 
 
 
318 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
275 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  38.97 
 
 
318 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  38.97 
 
 
346 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  38.97 
 
 
346 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  38.97 
 
 
346 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  38.97 
 
 
317 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  37.79 
 
 
322 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  36.24 
 
 
589 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.38 
 
 
305 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  37.33 
 
 
308 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  39.65 
 
 
304 aa  156  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  38.71 
 
 
335 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  37.96 
 
 
312 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  37.78 
 
 
318 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  37.79 
 
 
313 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  38.36 
 
 
929 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  38.36 
 
 
593 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  40.47 
 
 
326 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.44 
 
 
322 aa  155  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
282 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  36.87 
 
 
327 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  38.79 
 
 
328 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  38.79 
 
 
588 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  34.94 
 
 
915 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  34.8 
 
 
323 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  39.81 
 
 
312 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  42.03 
 
 
315 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
309 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  35.22 
 
 
580 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  42.99 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  40.99 
 
 
590 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  39.48 
 
 
311 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  37.6 
 
 
617 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3742  ABC transporter related  40 
 
 
339 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  40.09 
 
 
326 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  38.22 
 
 
320 aa  151  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  35.83 
 
 
909 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  37.5 
 
 
943 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1510  ABC transporter related  41.98 
 
 
360 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.326694 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
323 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  37.28 
 
 
314 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
583 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  36.49 
 
 
307 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  39.38 
 
 
317 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  38.81 
 
 
304 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  38.81 
 
 
326 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>