More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0417 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  100 
 
 
251 aa  484  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  68.47 
 
 
283 aa  287  9e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  60.91 
 
 
245 aa  266  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  62.18 
 
 
245 aa  265  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  59.09 
 
 
247 aa  261  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  58.54 
 
 
249 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  57.94 
 
 
238 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2957  ABC transporter related  57.08 
 
 
253 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3001  ABC transporter related  57.08 
 
 
253 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2972  ABC transporter related  56.61 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  0.0110597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  56.38 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2393  ABC transporter related protein  57.08 
 
 
243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5570  ABC transporter related  59.15 
 
 
239 aa  234  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0010719  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11703  ATP-binding protein ABC transporter  52.05 
 
 
255 aa  223  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.228043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  59.73 
 
 
522 aa  221  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  53.31 
 
 
254 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  42.06 
 
 
241 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 
248 aa  195  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  40.25 
 
 
242 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 
241 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  45.54 
 
 
318 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  45.09 
 
 
346 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  45.54 
 
 
318 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  45.54 
 
 
318 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  45.09 
 
 
346 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  45.09 
 
 
346 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  46.93 
 
 
315 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 
241 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 
241 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
248 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  43.28 
 
 
248 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 
241 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  45.09 
 
 
318 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  41.74 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  44.84 
 
 
317 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
248 aa  189  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
241 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.75 
 
 
322 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
248 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  40.47 
 
 
222 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  40.47 
 
 
222 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.7 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  40.36 
 
 
323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  41.07 
 
 
322 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.08 
 
 
907 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  41.26 
 
 
308 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.68 
 
 
248 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  43.33 
 
 
286 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  40.87 
 
 
335 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  41.1 
 
 
313 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  45.65 
 
 
311 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  39.74 
 
 
327 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 
323 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  41.1 
 
 
340 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  38.4 
 
 
255 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  37.74 
 
 
582 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 
308 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  40.37 
 
 
328 aa  168  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  42.86 
 
 
326 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  42.86 
 
 
326 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  46.8 
 
 
283 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  42.29 
 
 
322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  36.14 
 
 
580 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
580 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  44.29 
 
 
317 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  37.2 
 
 
585 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  38.4 
 
 
576 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  36.63 
 
 
576 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  42.29 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  43.18 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  42.34 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  36.44 
 
 
579 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  38.77 
 
 
311 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0738  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.27 
 
 
245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032696  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  42.6 
 
 
316 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  38.65 
 
 
580 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  36.8 
 
 
581 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  38.4 
 
 
915 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  39.22 
 
 
588 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
305 aa  161  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  36.9 
 
 
585 aa  161  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  41.67 
 
 
328 aa  161  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  36.89 
 
 
590 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  37.3 
 
 
904 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  41.89 
 
 
313 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  42.41 
 
 
314 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 
578 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  36.47 
 
 
510 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  39.57 
 
 
578 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0260  ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 
238 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000146773  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  37.14 
 
 
913 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  37.96 
 
 
916 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.45 
 
 
913 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  37.14 
 
 
913 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  37.14 
 
 
913 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
578 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
578 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  44.34 
 
 
308 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
578 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>