More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5570 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5570  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0010719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  61.74 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  59.83 
 
 		 245 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  60.85 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  58.65 
 
 		 245 aa  255  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2957  ABC transporter related  56.71 
 
 		 253 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3001  ABC transporter related  56.71 
 
 		 253 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2972  ABC transporter related  56.28 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  0.0110597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  59.15 
 
 		 251 aa  247  9e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  55.88 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.73 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  54.94 
 
 		 254 aa  235  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11703  ATP-binding protein ABC transporter  56.28 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.228043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2393  ABC transporter related protein  55.46 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  54.73 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  56.19 
 
 		 522 aa  205  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  39.5 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  36.91 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  37.29 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  37.71 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  39.17 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  39.17 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 308 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  41.98 
 
 		 322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  41.7 
 
 		 936 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 241 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  36.78 
 
 		 921 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.46 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  40.43 
 
 		 942 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  38.63 
 
 		 927 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.87 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  45.12 
 
 		 317 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  37.5 
 
 		 918 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  41.06 
 
 		 323 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  38.91 
 
 		 909 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  39.26 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  38.03 
 
 		 933 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  40.09 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  39.83 
 
 		 346 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  39.83 
 
 		 346 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  43.58 
 
 		 319 aa  158  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 340 aa  158  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 317 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  37.61 
 
 		 914 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  38.3 
 
 		 904 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  37.33 
 
 		 307 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  37.29 
 
 		 906 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  38.2 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  38.7 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  40.27 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  43.48 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  39.32 
 
 		 929 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  38.7 
 
 		 327 aa  155  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.32 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  38.56 
 
 		 918 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  37.76 
 
 		 911 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  37.76 
 
 		 911 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0260  ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000146773  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  38.14 
 
 		 936 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  37.76 
 
 		 911 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  40.17 
 
 		 916 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  37.76 
 
 		 911 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  37.76 
 
 		 911 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  37.76 
 
 		 911 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  38.14 
 
 		 936 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  37.76 
 
 		 911 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  37.76 
 
 		 911 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  37.76 
 
 		 911 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  37.71 
 
 		 924 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 		 930 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  42.53 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  39.15 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  38.36 
 
 		 317 aa  154  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 		 1089 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  38.84 
 
 		 1066 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  37.83 
 
 		 915 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.17 
 
 		 907 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  39.91 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.84 
 
 		 1082 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  38.46 
 
 		 916 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.43 
 
 		 1017 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 		 350 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  40.09 
 
 		 318 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  36.93 
 
 		 921 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  37.08 
 
 		 919 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  40.47 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  39.15 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0738  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.59 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032696  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.84 
 
 		 1079 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  38.33 
 
 		 906 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.84 
 
 		 1071 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  40.09 
 
 		 318 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>