More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0578 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  61.8 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  61.11 
 
 		 245 aa  281  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  56.12 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  58.23 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  57.83 
 
 		 254 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2957  ABC transporter related  53.39 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3001  ABC transporter related  53.39 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2972  ABC transporter related  52.97 
 
 		 253 aa  248  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  0.0110597 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.36 
 
 		 283 aa  239  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11703  ATP-binding protein ABC transporter  54.78 
 
 		 255 aa  238  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.228043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  54.98 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5570  ABC transporter related  55.88 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0010719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2393  ABC transporter related protein  54.01 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  53.78 
 
 		 522 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  40.83 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  41.56 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.48 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  41.55 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  46.12 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 242 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  40.57 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  44.13 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 305 aa  168  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 308 aa  168  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  39.17 
 
 		 512 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  43.56 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  37.61 
 
 		 322 aa  165  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  39.45 
 
 		 319 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  39.91 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  43.12 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  36.65 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  39.11 
 
 		 308 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 541 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  39.56 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  42.59 
 
 		 302 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  38.91 
 
 		 307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.48 
 
 		 907 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  38.91 
 
 		 324 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  43.06 
 
 		 323 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  39.52 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  42.59 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  42.73 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.04 
 
 		 914 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0738  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.48 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  40.72 
 
 		 304 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 930 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  40.45 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  42.58 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  37.18 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  38.56 
 
 		 906 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.89 
 
 		 308 aa  158  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  37.92 
 
 		 921 aa  158  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  36.51 
 
 		 908 aa  158  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  42.59 
 
 		 322 aa  157  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  40.62 
 
 		 319 aa  157  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  34.16 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 578 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0260  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000146773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  43.28 
 
 		 578 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 578 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 578 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  38.08 
 
 		 922 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 578 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  37.34 
 
 		 510 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 		 315 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  43.06 
 
 		 317 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 578 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 1171 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  43.07 
 
 		 578 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 589 aa  156  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  43.07 
 
 		 578 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 578 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  41.04 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  43.07 
 
 		 578 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  43.07 
 
 		 578 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  41.41 
 
 		 316 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  37.86 
 
 		 594 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  42.03 
 
 		 587 aa  156  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  42.27 
 
 		 291 aa  156  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  43.07 
 
 		 578 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  41.04 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  39.01 
 
 		 318 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>