More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22040 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 283 aa  540  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  68.91 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  62.87 
 
 		 245 aa  271  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  62.03 
 
 		 245 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5570  ABC transporter related  62.87 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0010719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  57.92 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  58.12 
 
 		 238 aa  245  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  57.63 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2957  ABC transporter related  57.08 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3001  ABC transporter related  57.08 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2972  ABC transporter related  56.65 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  0.0110597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  56.36 
 
 		 249 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  54.18 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2393  ABC transporter related protein  58.4 
 
 		 243 aa  228  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11703  ATP-binding protein ABC transporter  56.17 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.228043 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 248 aa  208  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  41.13 
 
 		 241 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 		 241 aa  205  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  55.66 
 
 		 522 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  41.86 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  41.86 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 241 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  41.81 
 
 		 242 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  42.42 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.96 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 248 aa  188  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 		 248 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  42.37 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  47.11 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  37.39 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  42.92 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  46.15 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  39.21 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  40.16 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.8 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.51 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  42.32 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  39.36 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0738  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.35 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  37.25 
 
 		 335 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  40.09 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  48.56 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  40.72 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 		 541 aa  171  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  41.51 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  40.43 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  40.43 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  41.78 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  40.43 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  41.38 
 
 		 321 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  39.36 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  39.75 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  36.32 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  40.43 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  38.98 
 
 		 927 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  40.71 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  40 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  39.22 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.27 
 
 		 907 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  39.26 
 
 		 667 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  34.89 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  35.25 
 
 		 906 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  37.34 
 
 		 327 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  41 
 
 		 326 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  40.59 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  41.88 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  38.57 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  39.68 
 
 		 930 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  39.13 
 
 		 922 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  41.98 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  40.79 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  42.48 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  38.74 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.23 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  42.48 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  40.89 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  36.78 
 
 		 901 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  41.04 
 
 		 918 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  37.23 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  36.78 
 
 		 901 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.62 
 
 		 913 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  41.41 
 
 		 304 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0260  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000146773  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  36.33 
 
 		 590 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  35.71 
 
 		 585 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  38.64 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  41.85 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  35.81 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  34.83 
 
 		 581 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  37.55 
 
 		 922 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>