More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SEA0018 on replicon NC_006663
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0260  ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 		 238 aa  247  9e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000146773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  48.93 
 
 		 242 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0738  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.57 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.72 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  48.46 
 
 		 241 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  48.02 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  48.02 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 241 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  47.62 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  44.21 
 
 		 244 aa  214  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  47.44 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  47.44 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  38.1 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  40.58 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 315 aa  178  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  38.56 
 
 		 254 aa  177  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 311 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5570  ABC transporter related  37.02 
 
 		 239 aa  174  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0010719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  40.36 
 
 		 310 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.1 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 		 541 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  37.99 
 
 		 373 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  37.99 
 
 		 304 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  38.94 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  36.17 
 
 		 593 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  39.45 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  36.65 
 
 		 316 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  39.53 
 
 		 308 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  37.5 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  37.99 
 
 		 326 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  37.55 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  40 
 
 		 355 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  37.99 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  35.68 
 
 		 340 aa  168  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.4 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 589 aa  168  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  37.99 
 
 		 304 aa  168  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  37.55 
 
 		 304 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  37.55 
 
 		 304 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 317 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  38.29 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  39.74 
 
 		 342 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 583 aa  166  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  34.05 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  36.55 
 
 		 599 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  39.13 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  37.29 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  37.39 
 
 		 915 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  37.12 
 
 		 304 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  35.75 
 
 		 593 aa  164  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  32.89 
 
 		 317 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  36.87 
 
 		 282 aa  164  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  34.63 
 
 		 245 aa  164  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  40.44 
 
 		 311 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  35.56 
 
 		 512 aa  164  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  35.06 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  39.19 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  36.87 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  37.44 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.28 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  35.86 
 
 		 314 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  35.06 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  35.65 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  36.48 
 
 		 327 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  36.05 
 
 		 921 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  39.33 
 
 		 313 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  38.49 
 
 		 323 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  38.49 
 
 		 323 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 		 350 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 		 308 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  37.29 
 
 		 313 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.21 
 
 		 320 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  39.11 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  37.93 
 
 		 307 aa  161  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  36.09 
 
 		 327 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  37.33 
 
 		 339 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  34.87 
 
 		 943 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  36.36 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.94 
 
 		 310 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  39.57 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  35.22 
 
 		 320 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  39.35 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  38.12 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  34.18 
 
 		 510 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  34.76 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  33.48 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  35.37 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  34.67 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  39.21 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>