More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2393 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2393  ABC transporter related protein  100 
 
 		 243 aa  474  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  60.17 
 
 		 245 aa  271  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  60.42 
 
 		 245 aa  271  9e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2957  ABC transporter related  58.26 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3001  ABC transporter related  58.26 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2972  ABC transporter related  57.85 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  0.0110597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 251 aa  254  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  56.07 
 
 		 254 aa  254  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.09 
 
 		 283 aa  244  6.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  54.01 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  53.81 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5570  ABC transporter related  55.46 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0010719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11703  ATP-binding protein ABC transporter  55.13 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.228043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  52.28 
 
 		 249 aa  228  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  53.88 
 
 		 254 aa  221  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  42.92 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  57.6 
 
 		 522 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  40.59 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  37.83 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  38.26 
 
 		 241 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  39.21 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  45.28 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  39.84 
 
 		 933 aa  171  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.04 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.92 
 
 		 308 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.32 
 
 		 308 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  39.06 
 
 		 575 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  39.39 
 
 		 583 aa  168  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  37.85 
 
 		 308 aa  168  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1514  ABC transporter related  37.88 
 
 		 205 aa  168  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  43.81 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37 
 
 		 578 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  37 
 
 		 578 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 578 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  38.81 
 
 		 313 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  36.64 
 
 		 576 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  37 
 
 		 578 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 578 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 578 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 578 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  37 
 
 		 578 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 578 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  36.93 
 
 		 580 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  39.47 
 
 		 943 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  38.28 
 
 		 322 aa  165  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  35.25 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  43.41 
 
 		 317 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 585 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  37.8 
 
 		 590 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 578 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  38.31 
 
 		 911 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  36.73 
 
 		 901 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 580 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  36.32 
 
 		 580 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 578 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  39.15 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  36.73 
 
 		 901 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 930 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 578 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 578 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  40.19 
 
 		 317 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  41.05 
 
 		 930 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 578 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0738  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.19 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  35.74 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  35.98 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  35.92 
 
 		 512 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  39.29 
 
 		 942 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  39.08 
 
 		 915 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  36.59 
 
 		 510 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  39.48 
 
 		 924 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  39.92 
 
 		 916 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  41.46 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  41.46 
 
 		 346 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  42.29 
 
 		 346 aa  161  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  37.4 
 
 		 582 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  39.25 
 
 		 318 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  39.29 
 
 		 936 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  38.3 
 
 		 927 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  39.25 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.91 
 
 		 907 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0260  ABC transporter, ATP-binding protein  34.19 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000146773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  39.25 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  39.25 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  36.63 
 
 		 930 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  36.9 
 
 		 590 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  35.71 
 
 		 911 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  35.71 
 
 		 911 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>