13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0561 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0561  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  826    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10730  ABC-2 type transporter  37.28 
 
 
393 aa  248  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0637  multidrug ABC transporter permease  26.36 
 
 
470 aa  122  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.274671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1223  ABC-2 type transporter  23.41 
 
 
386 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0696  hypothetical protein  21.39 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1307  ABC-2 type transporter  20.94 
 
 
371 aa  57  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000398946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  19.77 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  22.46 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  23.67 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  23.67 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  20.58 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  22.46 
 
 
381 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 
246 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>