23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1223 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1223  ABC-2 type transporter  100 
 
 
386 aa  776    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0561  hypothetical protein  23.1 
 
 
411 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1307  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 
371 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000398946  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10730  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0696  hypothetical protein  23.18 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  21.29 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  21.57 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 
381 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  21.29 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  21.02 
 
 
381 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  23.14 
 
 
381 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  21.64 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  22.13 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  21.35 
 
 
377 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0637  multidrug ABC transporter permease  24 
 
 
470 aa  50.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.274671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  21.85 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  21.57 
 
 
381 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  22.4 
 
 
380 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  21.57 
 
 
380 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  21.57 
 
 
380 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  21.28 
 
 
379 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  26.75 
 
 
378 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  21.92 
 
 
386 aa  43.1  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>