238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1730 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  96.29 
 
 		 377 aa  744    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  51.21 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  32.12 
 
 		 780 aa  157  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  28.9 
 
 		 383 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  30.75 
 
 		 367 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  28.09 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  28.12 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 392 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 383 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  27.54 
 
 		 383 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  27.54 
 
 		 383 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  27.25 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  30.57 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  28.37 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  27.81 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  25.68 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 496 aa  96.7  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  25.98 
 
 		 293 aa  93.2  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  24.59 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  28.79 
 
 		 375 aa  86.3  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  29.73 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  30.16 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  22.85 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  30.16 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  25.33 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  24.13 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  29.45 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  23.15 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  24.23 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  26.15 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  27.21 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  21.99 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  21.79 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  23.08 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  22.77 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  23.01 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  24.36 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.3 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  23.84 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  33.09 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  28.64 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.41 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  22.77 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  22.11 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  27.44 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  21.45 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  27.06 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  25.32 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  22.76 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  23.61 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  21.8 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  23.91 
 
 		 382 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  22.62 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  23.41 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  23.25 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  23.37 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>