124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0620 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 378 aa  764    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  45.03 
 
 		 383 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  46.96 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  47.37 
 
 		 383 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  42.89 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  38.5 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  38.61 
 
 		 379 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  38.5 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  38.23 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  37.95 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  36.65 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  36.91 
 
 		 383 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  36.91 
 
 		 383 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  38.23 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  36.15 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  38.3 
 
 		 384 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  38.11 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  36.87 
 
 		 384 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  36.87 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  33.86 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  35.63 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  30.97 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 780 aa  176  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 395 aa  171  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 367 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 		 496 aa  163  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  25.41 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  28.16 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  27.75 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  26.59 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  28.97 
 
 		 293 aa  133  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  28.37 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  21.55 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  27.74 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  30.38 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  25.55 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  25.16 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  25.34 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  24.7 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  23.03 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  22.76 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  25 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  22.88 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  21.33 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  21.19 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  20.22 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  21.66 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  22.75 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  22.67 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  24.84 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  20.1 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  25 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  20.83 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  20.12 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  25 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  20.07 
 
 		 379 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 378 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  25.29 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  19.88 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  22.22 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  21.15 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  19.8 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.39 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  20.72 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  24.06 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  20.61 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  20.18 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  22.47 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  20.88 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  20.49 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  21.65 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  26.42 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  31.58 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  22.42 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  21.31 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>