More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0489 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  85.68 
 
 		 405 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  82.33 
 
 		 430 aa  695    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  83.82 
 
 		 408 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  89.15 
 
 		 435 aa  749    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  82.33 
 
 		 430 aa  674    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  98.14 
 
 		 429 aa  844    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 429 aa  862    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  93.79 
 
 		 431 aa  784    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  85.43 
 
 		 405 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  70.49 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  66.11 
 
 		 390 aa  475  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  64.46 
 
 		 387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  63.09 
 
 		 387 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  60.7 
 
 		 390 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  58.38 
 
 		 375 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  37.05 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  35.48 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  38.19 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  33.69 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  34.01 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  32.8 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  31.3 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  27.32 
 
 		 434 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  27.81 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  25.21 
 
 		 383 aa  116  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  26.1 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  27.09 
 
 		 491 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  27.81 
 
 		 390 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 395 aa  93.6  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 780 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  27.55 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 367 aa  86.3  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  23.8 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  23.71 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  24.72 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  28.05 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  22.93 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  24.23 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  23.33 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  21.41 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  24.67 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.31 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  28.64 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  23.19 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  26.18 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  25 
 
 		 942 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.16 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  23.91 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  27.06 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  23.59 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  23.77 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  25.26 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  22.06 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  23.35 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  22.04 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  21.76 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  25.6 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.58 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  23.24 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  23.06 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  23.38 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  23.01 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  24.04 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  22.88 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 370 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  25.31 
 
 		 370 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  23.17 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  22.75 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  22.03 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  22.7 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  24.8 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  26.07 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  22.59 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>