More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0596 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 395 aa  803    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  31.65 
 
 		 405 aa  235  9e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 780 aa  182  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  29.49 
 
 		 383 aa  179  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  29.22 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 381 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 379 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 378 aa  176  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  28 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  28.15 
 
 		 378 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  29.38 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  28.08 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  27.54 
 
 		 397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  30.14 
 
 		 293 aa  157  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  27.64 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  29.78 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 384 aa  145  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 496 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  24.93 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 381 aa  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 367 aa  126  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  26.3 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  23.71 
 
 		 377 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  23.71 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  23.64 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  27.43 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  25.47 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  27.16 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  27.3 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  27.6 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  34.34 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  22.51 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 366 aa  99.8  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  22.88 
 
 		 405 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  30.77 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  23.36 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  23.26 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  23.14 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  22.19 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  29.26 
 
 		 387 aa  94  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  28.16 
 
 		 491 aa  93.2  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 429 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  24.79 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 430 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  24.01 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.54 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  22.55 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 378 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 429 aa  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  28.37 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  24.85 
 
 		 435 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  22.04 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  22.65 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.69 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.78 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  22.32 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  25 
 
 		 906 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  23.74 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  25.23 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  25 
 
 		 906 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  22.46 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  22.85 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  23.42 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  25.39 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.73 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.4 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  21.24 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  24.67 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  31.48 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>