223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1841 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  801    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  48.41 
 
 		 387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  45.17 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  45.03 
 
 		 362 aa  323  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  40.91 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  36.47 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  35.13 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 429 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 		 387 aa  205  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  32.71 
 
 		 435 aa  203  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 		 429 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  36.39 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  37.14 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  32.7 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  35.65 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 		 430 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  34.76 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  35.67 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  34.87 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  33.82 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  31.01 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 395 aa  153  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  26.79 
 
 		 434 aa  135  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  24.71 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  24.85 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 384 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 780 aa  117  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  30.03 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  29.74 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  28.11 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  29.36 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  24 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  20.26 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  21.26 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  26.21 
 
 		 293 aa  72.8  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  21.61 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  20.9 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  28.64 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  22.09 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  21.28 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  20.76 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  20.63 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  28.66 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  20.76 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  21.24 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  23.26 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  26.3 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  20.88 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  26.32 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  23.77 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  21.97 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  22.22 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  25.84 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  21.82 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  28.3 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  24.64 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  21.47 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  26.21 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  26 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  27.56 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  26.92 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  20.6 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  23.61 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  24.36 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  22.11 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  26.92 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  22.82 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  23.78 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  21.3 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.15 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  27.27 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  20.53 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  22.26 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  20.32 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  21.93 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  23.65 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>