219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0480 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  764    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  68.41 
 
 
383 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  67.98 
 
 
383 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  69.07 
 
 
381 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  69.27 
 
 
379 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  67.45 
 
 
383 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  67.45 
 
 
383 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  68.27 
 
 
382 aa  518  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  67.73 
 
 
378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  68.27 
 
 
381 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  67.82 
 
 
384 aa  501  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  61.11 
 
 
381 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  61.07 
 
 
384 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  63.06 
 
 
382 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  60.39 
 
 
381 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  42.97 
 
 
397 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  43.57 
 
 
392 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  40.58 
 
 
382 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  39.95 
 
 
383 aa  282  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  38.87 
 
 
395 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  39.13 
 
 
383 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  36.87 
 
 
378 aa  246  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 
780 aa  176  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  29.56 
 
 
397 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 
496 aa  156  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  26.39 
 
 
405 aa  150  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 
395 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  30 
 
 
367 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  33.05 
 
 
375 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 
377 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  28.62 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  27.4 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  27.91 
 
 
377 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  23.38 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  25.37 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 
370 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  22.52 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  27.27 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  27.85 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  23.55 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  21.75 
 
 
391 aa  76.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  30.67 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  22.37 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  24.3 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  24.92 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  22.97 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  23.82 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  23.86 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  23.42 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  23.38 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  22.33 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  26.34 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  31.33 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  23.15 
 
 
374 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  21.95 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 
373 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 
372 aa  64.3  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  22.5 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  24.7 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  23.76 
 
 
387 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  22.01 
 
 
388 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  23.7 
 
 
362 aa  63.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 
381 aa  62.8  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  25.56 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  22.82 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.17 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.68 
 
 
384 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  25.49 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.31 
 
 
384 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  21.62 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  21.62 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 
373 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  21.62 
 
 
373 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  21.62 
 
 
373 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 
384 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  22.1 
 
 
387 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.26 
 
 
381 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  23 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  24.55 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  25.33 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  20.98 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  21.68 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>