120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1038 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  873    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  51.91 
 
 
491 aa  450  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  46.58 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  27.18 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  27.52 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  27.03 
 
 
371 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  28.27 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 
431 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 
405 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  25.81 
 
 
387 aa  123  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  26.78 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  31.9 
 
 
372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  33.8 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  27.3 
 
 
362 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 
429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  22.11 
 
 
383 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 
430 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 
405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  31.19 
 
 
387 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  25.67 
 
 
390 aa  99.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  24.56 
 
 
402 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 
395 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 
780 aa  93.2  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 
395 aa  89.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  30.54 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  27.47 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  28.02 
 
 
383 aa  77  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  29.45 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  26.26 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  27.61 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  27.6 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  19.89 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  22.05 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  28.4 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 
496 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  26.63 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 
379 aa  67  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 
376 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  25.73 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  22.07 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 
378 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  25 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 
379 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  24.16 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  27.14 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  22.47 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  23.92 
 
 
390 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  21.54 
 
 
381 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  23.82 
 
 
390 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  20.38 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  21.53 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 
379 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 
383 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  22.47 
 
 
356 aa  53.5  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  22.1 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  21.24 
 
 
368 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  22.47 
 
 
374 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 
381 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  22.06 
 
 
377 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  20.57 
 
 
377 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  20.77 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 
381 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 
384 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 
382 aa  51.2  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 
382 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  19.4 
 
 
366 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  23.2 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  22.85 
 
 
367 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  21.68 
 
 
381 aa  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  21.3 
 
 
378 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  23.87 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  18.35 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  21.63 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 
367 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  20.3 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  22.4 
 
 
378 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  19.29 
 
 
378 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  21.28 
 
 
378 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  18.75 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 
384 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  25.64 
 
 
375 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  20.27 
 
 
399 aa  46.6  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 
383 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  22.94 
 
 
383 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>