More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0584 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  85.49 
 
 		 435 aa  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  87.16 
 
 		 405 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 408 aa  823    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  86.49 
 
 		 430 aa  665    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  85.68 
 
 		 405 aa  674    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  84.03 
 
 		 429 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  83.82 
 
 		 429 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  84.79 
 
 		 431 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  86.24 
 
 		 430 aa  687    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  66.84 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  57.89 
 
 		 390 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  62.8 
 
 		 387 aa  474  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  65.28 
 
 		 390 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  63.03 
 
 		 387 aa  455  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  56.11 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  38.38 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  34.01 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  37.43 
 
 		 362 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  32.88 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  34.48 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  34.87 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  30.29 
 
 		 378 aa  176  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  27.72 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  26.44 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  26.89 
 
 		 491 aa  107  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  24.29 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  25.22 
 
 		 379 aa  93.2  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  28.88 
 
 		 390 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  27.78 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 780 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  24.59 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  22.76 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  22.02 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 496 aa  80.5  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  22.75 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  24.01 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  28.14 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  21.95 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.71 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  28.21 
 
 		 293 aa  76.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  25.07 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  23.06 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  23.25 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  20.16 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  22.32 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  23.59 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  24.92 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  27.12 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1496  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.679397  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  24.79 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2362  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0759041  normal  0.863187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  23.26 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  23.88 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  23.27 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  25.85 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  23.55 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  27.23 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  23.67 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  21.63 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  23.35 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  21.04 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  22.45 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1825  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0526143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  22.13 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  23.44 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  23.82 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  23.53 
 
 		 942 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  23.75 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.64 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  21.47 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  23.35 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>