More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0597 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  778    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  26.33 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  29.87 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  29.05 
 
 		 387 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 391 aa  143  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 780 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  26.2 
 
 		 362 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  25.81 
 
 		 395 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  25.98 
 
 		 435 aa  119  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  22.11 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  31.32 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  23.73 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 429 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 430 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  23.89 
 
 		 395 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  23.4 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  23.62 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  22.89 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 430 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 405 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  25.56 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  25.9 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  24.18 
 
 		 379 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 408 aa  96.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 395 aa  95.9  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  22.86 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  25.3 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  22.25 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  24.84 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  28.51 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 378 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  23.51 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 496 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  23.24 
 
 		 378 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  28.28 
 
 		 293 aa  89.7  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  24.93 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  24.93 
 
 		 383 aa  86.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  23.34 
 
 		 382 aa  86.3  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  24.6 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  23.16 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  25.45 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  22.5 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  24.85 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.87 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  22.12 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  23.96 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  19.68 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.89 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  22.08 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  24.67 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  24.92 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  22.86 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  22.58 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  23.1 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  20.9 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.56 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.07 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  20.98 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  22.32 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  23.95 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  22.49 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  22.01 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.78 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  23.98 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  24.59 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  20.18 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  20.32 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  23.2 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>