More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0091 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0091  transporter, putative  100 
 
 		 405 aa  831    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 780 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  31.65 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  32.19 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  28.8 
 
 		 383 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  28.53 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 381 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 381 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  26.5 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  28.2 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  28.73 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  32.07 
 
 		 293 aa  146  7.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  26.08 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  27.32 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  26.68 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  25.64 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  25.95 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  28.09 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  28.09 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  26.06 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  27.65 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 377 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  23.64 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  25.56 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  22.64 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  26.85 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  23.35 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  22.83 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  23.91 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  22.72 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  24.13 
 
 		 378 aa  87  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  23.72 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  26.27 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  20.8 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  21.8 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  22.77 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  24.07 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.81 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  23.93 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  22.43 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  20.34 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  20.84 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  25.07 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  28.83 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  23.14 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  23.9 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  25.28 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  28.81 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  23.06 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  26.32 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  21.28 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  27.04 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  21.45 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  23.44 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  22.53 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  21.09 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  21.26 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  21.59 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  23.55 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>