More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4570 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 417 aa  798    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  39.81 
 
 		 434 aa  276  7e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  41.48 
 
 		 491 aa  193  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  32.49 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  28.77 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  35.2 
 
 		 395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  30.51 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  34.84 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  28.83 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  32.77 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  31.67 
 
 		 429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  31.64 
 
 		 362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  30.75 
 
 		 405 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  31.49 
 
 		 384 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  30.56 
 
 		 372 aa  142  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  30.52 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  34.17 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 		 405 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  29.84 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  28.53 
 
 		 391 aa  133  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 780 aa  126  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  29.59 
 
 		 390 aa  117  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  30.75 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  29.77 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  26.68 
 
 		 389 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  26.61 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  26.93 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  28.08 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  26.76 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  27.13 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  24.22 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  22.6 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  24.8 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  32.86 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  26.9 
 
 		 293 aa  72.8  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  30.29 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  21.39 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  21.39 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 378 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  32.02 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  24.84 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  31.79 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  24.75 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  23.08 
 
 		 373 aa  67  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 		 370 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  22.53 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  23.12 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  21.96 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  25.88 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  24.22 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  23.48 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  24.16 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  36.28 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  26.29 
 
 		 942 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  25.07 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  23.85 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>