205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0092 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0092  transporter, putative  100 
 
 		 379 aa  775    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  26.22 
 
 		 383 aa  173  5.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  29.38 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  27 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  24.71 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  25.94 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 780 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  24.86 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  25.41 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  27.33 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  27.27 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  24.55 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  26.46 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  25.92 
 
 		 429 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  26.35 
 
 		 430 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  26.12 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  21.95 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  23.8 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 430 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  21.85 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  21.36 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  24.18 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  24.29 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.52 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  25.08 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  22.73 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  22.05 
 
 		 434 aa  69.3  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  21.64 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  23.06 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  25.91 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  20.63 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  22.81 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  23.53 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  25.97 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.64 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  25.2 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  24.13 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  24.93 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  28.21 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  24.18 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.91 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  22.58 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  22.58 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  22.75 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  24.71 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  22.32 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  20.11 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  25.21 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  26.46 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.34 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  21.34 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  23.56 
 
 		 901 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  21.59 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>