177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003315 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  100 
 
 		 383 aa  776    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  90.58 
 
 		 383 aa  672    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  66.67 
 
 		 382 aa  512  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  50.13 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  45.03 
 
 		 378 aa  337  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  46.51 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  46.24 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  42.67 
 
 		 381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  42.67 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  42.36 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  42.13 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  41.78 
 
 		 383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  41.78 
 
 		 383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  41.78 
 
 		 383 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  42.63 
 
 		 378 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  42.13 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  40.68 
 
 		 382 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  41.55 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  40.94 
 
 		 381 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  40.85 
 
 		 382 aa  269  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  40.34 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  40.9 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  34.59 
 
 		 780 aa  196  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  33.42 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 496 aa  169  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  32.1 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  26.5 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  28.9 
 
 		 377 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  28.9 
 
 		 377 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  29.55 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  28.86 
 
 		 375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  25.42 
 
 		 379 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  25.61 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  23.51 
 
 		 435 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  26.55 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  24.93 
 
 		 383 aa  87  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  24.2 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  22.97 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  26.85 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  22.53 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  22.43 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  27.47 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  24.25 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  21.36 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  24.25 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  22.44 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  23.3 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  30.26 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  22.19 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  23.42 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  26.9 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  27.04 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  25.73 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  29.89 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  25.16 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  20.18 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  24.11 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  26.21 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  26.83 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  21.1 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  25.31 
 
 		 491 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.14 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  21.64 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  21.17 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  26.3 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  21.92 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  19.89 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.25 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.12 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  21.23 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  22.19 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  23.55 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  19.38 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  22.13 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>