284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_05041 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  100 
 
 
284 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.112221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1781  putative multidrug efflux ABC transporter  99.3 
 
 
284 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  71.48 
 
 
277 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  70.67 
 
 
284 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  71.48 
 
 
284 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06471  putative multidrug efflux ABC transporter  71.83 
 
 
284 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  68.52 
 
 
274 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  69.23 
 
 
274 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  69.29 
 
 
274 aa  355  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  67.28 
 
 
274 aa  349  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  58.21 
 
 
296 aa  302  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  58.03 
 
 
298 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  58.03 
 
 
298 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  55.79 
 
 
298 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  58.15 
 
 
295 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  59.64 
 
 
286 aa  288  6e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  56.93 
 
 
291 aa  284  9e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  57.55 
 
 
294 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
260 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.33 
 
 
284 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 
257 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  33.82 
 
 
241 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  34.27 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.57 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 
288 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.41 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.57 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28.11 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.65 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  33.98 
 
 
251 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
289 aa  85.9  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.44 
 
 
256 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.44 
 
 
256 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 
250 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.03 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.66 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  31.88 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  28.93 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  25.59 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.83 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.14 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  31.05 
 
 
241 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  26.91 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.84 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.42 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  30.65 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  25.44 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.37 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  25 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.94 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  29.95 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1945  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0850168  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  27.04 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  26.01 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.64 
 
 
249 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 
258 aa  62.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>