198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12952 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12952  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrC  100 
 
 		 276 aa  541  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  45.22 
 
 		 287 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  45.22 
 
 		 287 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  45.22 
 
 		 287 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  48.64 
 
 		 281 aa  244  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3120  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.47 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3737  ABC-2 type transporter  36.05 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4327  ABC-2 type transporter  37.24 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3107  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3167  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.21 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  34.68 
 
 		 264 aa  92.4  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  24.8 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2830  ABC transporter, DrrB efflux protein  29.96 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2874  multidrug ABC transporter inner membrane protein  29.96 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2859  multidrug ABC transporter inner membrane protein  29.96 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4328  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.29 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  25.42 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.69 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  25 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  26.27 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  29.43 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  25 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  25 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  26.1 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  25 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  25 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  25.61 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0654  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  24.07 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  26.3 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  25 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3121  multidrug ABC transporter inner membrane protein  27.39 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.93 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3388  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  24.17 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.48 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.55 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.55 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  24.58 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  23.98 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  24.88 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12951  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrB  27.63 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  22.64 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  23.38 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  24.88 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.32 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>