169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3107 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3107  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 264 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3167  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 264 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  30.56 
 
 		 287 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  30.56 
 
 		 287 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  30.56 
 
 		 287 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12952  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrC  32.52 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  31.37 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3737  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3120  multidrug ABC transporter inner membrane protein  32.81 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4327  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.95 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1754  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00326384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.8 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.39 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  26.4 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 286 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  22.87 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  23.69 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  22.66 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5081  ABC transporter related protein  24.81 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  22.61 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  26.77 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  26.67 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  21.93 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  22.62 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  26.96 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  27.73 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  26.52 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  23.19 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  28.78 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  25.77 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.22 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  21.66 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  22.99 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2830  ABC transporter, DrrB efflux protein  25.13 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2874  multidrug ABC transporter inner membrane protein  25.13 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2859  multidrug ABC transporter inner membrane protein  25.13 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 298 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  21.17 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  25.39 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3121  multidrug ABC transporter inner membrane protein  28.22 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>