205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1754 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1754  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 250 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00326384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.92 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3737  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4327  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  32.66 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  34.29 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 254 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  33.33 
 
 		 287 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  33.33 
 
 		 287 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  33.33 
 
 		 287 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3120  multidrug ABC transporter inner membrane protein  33.88 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 284 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  30.49 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  26.8 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.6 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  29.53 
 
 		 289 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  26.8 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  26.91 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 		 285 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 267 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 267 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  26.51 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  26.8 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  26.8 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  26.8 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  29.39 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  26.8 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 270 aa  89  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 254 aa  89  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  25.7 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  28.05 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.1 
 
 		 277 aa  85.5  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3107  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3167  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  33.5 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.38 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.29 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.29 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.32 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  29.31 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  27.49 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3106  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3166  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>