99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4188 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4188  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00904545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  58.18 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  51.92 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  51.85 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  47.71 
 
 		 254 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  48.15 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  52.43 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  55.56 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  46.79 
 
 		 253 aa  99  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  48.36 
 
 		 257 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  45.87 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  43.52 
 
 		 254 aa  95.5  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  45.87 
 
 		 256 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  49.55 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  40.65 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  42.59 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  42.59 
 
 		 249 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 249 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  56.18 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  49.49 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  42.59 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  44.95 
 
 		 264 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  52.44 
 
 		 259 aa  89  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  41.67 
 
 		 249 aa  89  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  39.02 
 
 		 249 aa  89  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  43.27 
 
 		 253 aa  88.2  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  45.45 
 
 		 263 aa  88.2  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  40.74 
 
 		 249 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  40.74 
 
 		 249 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  40.74 
 
 		 249 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  45.56 
 
 		 270 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  46.96 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  45.19 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  46.36 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  47.52 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  43.64 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0287  ABC-2 type transporter  47.27 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  42.11 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  47.44 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  33.66 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  39.62 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  44.12 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  37.36 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  43.24 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  42.31 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 		 273 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  38.89 
 
 		 274 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  40.3 
 
 		 280 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.62 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  38.1 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  37.66 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  34.69 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  34.11 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  35.8 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  40 
 
 		 281 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  34.41 
 
 		 287 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  34.41 
 
 		 287 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  34.41 
 
 		 287 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 		 280 aa  48.5  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  42.47 
 
 		 273 aa  48.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  37.68 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  38.03 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  33.04 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  33.04 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 		 284 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  33.04 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.41 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 		 285 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  36.11 
 
 		 280 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.57 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  37.66 
 
 		 300 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  37.66 
 
 		 286 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  35.38 
 
 		 282 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  35.38 
 
 		 282 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  35.38 
 
 		 282 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 		 318 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 267 aa  45.1  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.33 
 
 		 281 aa  45.1  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  32.32 
 
 		 271 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  36 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.59 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.78 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  35.38 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.49 
 
 		 284 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  39.13 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  29.55 
 
 		 281 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3120  multidrug ABC transporter inner membrane protein  29.55 
 
 		 284 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  37.97 
 
 		 267 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  33.66 
 
 		 278 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>