83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1896 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1896  membrane protein-like protein  100 
 
 
380 aa  763    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3135  hypothetical protein  34.79 
 
 
393 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2823  hypothetical protein  35.25 
 
 
393 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3117  hypothetical protein  34.79 
 
 
393 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2897  hypothetical protein  34.79 
 
 
393 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3114  hypothetical protein  34.79 
 
 
393 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2892  hypothetical protein  34.79 
 
 
393 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0559889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2132  phage infection protein  35.08 
 
 
393 aa  222  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3138  hypothetical protein  34.79 
 
 
393 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.393136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2866  hypothetical protein  34.97 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.96349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3105  phage infection protein  33.59 
 
 
393 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2446  hypothetical protein  28.93 
 
 
425 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2400  hypothetical protein  28.93 
 
 
425 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.361611  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1448  hypothetical protein  30.36 
 
 
474 aa  66.6  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.688687  normal  0.5559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  25.76 
 
 
772 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6227  hypothetical protein  24.23 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  33.06 
 
 
953 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.12 
 
 
737 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3154  membrane protein-like protein  24.24 
 
 
470 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.131996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  32.77 
 
 
940 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10181  transmembrane protein  23.21 
 
 
452 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.34 
 
 
857 aa  59.7  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  33.06 
 
 
941 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  32.23 
 
 
953 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  32.48 
 
 
953 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  32.48 
 
 
953 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  32.48 
 
 
981 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  32.23 
 
 
941 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  32.48 
 
 
991 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  32.23 
 
 
941 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  24.2 
 
 
887 aa  57  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  27.45 
 
 
1111 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5806  hypothetical protein  22.37 
 
 
442 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.49 
 
 
769 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 
825 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  29.13 
 
 
869 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  30.71 
 
 
718 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  29.13 
 
 
869 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  29.13 
 
 
869 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  25.63 
 
 
666 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  29.13 
 
 
923 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  28.35 
 
 
911 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  29.13 
 
 
924 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  29.13 
 
 
1114 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  24.39 
 
 
666 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  31.67 
 
 
915 aa  53.9  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  30 
 
 
718 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  25.32 
 
 
666 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  22.53 
 
 
876 aa  53.1  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  24.15 
 
 
666 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  26.35 
 
 
669 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  24.68 
 
 
666 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  25.32 
 
 
663 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  28.35 
 
 
869 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  24.68 
 
 
666 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  24.36 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0159  hypothetical protein  26.36 
 
 
412 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  24.86 
 
 
823 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  24.1 
 
 
597 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  24.68 
 
 
666 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 
981 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  27.01 
 
 
754 aa  50.1  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.97 
 
 
797 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  30.19 
 
 
955 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  24.03 
 
 
666 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  24.29 
 
 
720 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.44 
 
 
705 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  23.93 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  24.54 
 
 
779 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  25.56 
 
 
876 aa  47.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  31.11 
 
 
724 aa  47  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.27 
 
 
881 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  30.3 
 
 
721 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  30.37 
 
 
721 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  26.67 
 
 
142 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  25.53 
 
 
954 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.88 
 
 
723 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  28.46 
 
 
721 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 
379 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  23.79 
 
 
958 aa  43.5  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 
414 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  21.15 
 
 
1037 aa  43.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  24.06 
 
 
695 aa  43.1  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>