82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1908 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1908  membrane protein-like protein  100 
 
 		 642 aa  1275    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1481  membrane protein-like protein  33.17 
 
 		 770 aa  204  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0291099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  24.81 
 
 		 863 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11800  X-X-X-Leu-X-X-Gly heptad repeat-containing protein  31.28 
 
 		 853 aa  156  9e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.032406 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  26.76 
 
 		 767 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.53 
 
 		 769 aa  87.8  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  26.44 
 
 		 1111 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 733 aa  80.9  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  27.09 
 
 		 666 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  23.64 
 
 		 1114 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 		 825 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1037 aa  80.5  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  26.42 
 
 		 666 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.95 
 
 		 797 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.03 
 
 		 782 aa  78.6  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  25.91 
 
 		 772 aa  78.6  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.41 
 
 		 737 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  24.42 
 
 		 666 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  27.21 
 
 		 695 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  23.71 
 
 		 869 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  27.18 
 
 		 666 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  23.71 
 
 		 869 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  26.24 
 
 		 915 aa  75.9  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  24.54 
 
 		 869 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  24.84 
 
 		 869 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  25.91 
 
 		 663 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  27.2 
 
 		 911 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  26.6 
 
 		 666 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  26.6 
 
 		 666 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.77 
 
 		 732 aa  74.7  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  24.76 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.88 
 
 		 692 aa  73.9  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  26.68 
 
 		 772 aa  73.9  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0160  hypothetical protein  24.78 
 
 		 630 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2395  hypothetical protein  21.91 
 
 		 625 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.553674 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  26.46 
 
 		 666 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1708  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  26.09 
 
 		 504 aa  72  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  25.32 
 
 		 512 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  23.62 
 
 		 759 aa  71.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  23.61 
 
 		 924 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  23.39 
 
 		 923 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.44 
 
 		 711 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3277  hypothetical protein  28.12 
 
 		 217 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  26.69 
 
 		 1041 aa  64.7  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.29 
 
 		 740 aa  64.7  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  23.51 
 
 		 819 aa  64.3  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  23.41 
 
 		 683 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  25.08 
 
 		 1038 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  24.92 
 
 		 1038 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  26.35 
 
 		 1038 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  24.71 
 
 		 1038 aa  61.6  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1041 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  24.58 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  26.28 
 
 		 1038 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1246 aa  60.5  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  24.58 
 
 		 888 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  22.43 
 
 		 789 aa  58.9  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  25.72 
 
 		 721 aa  58.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  23.1 
 
 		 1049 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  26.16 
 
 		 1040 aa  57  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  23.81 
 
 		 623 aa  57  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.62 
 
 		 678 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.74 
 
 		 946 aa  54.7  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25 
 
 		 785 aa  54.7  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.25 
 
 		 1211 aa  54.3  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  28.07 
 
 		 955 aa  53.9  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  27.04 
 
 		 988 aa  54.3  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.44 
 
 		 666 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.86 
 
 		 857 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  24.84 
 
 		 1054 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 678 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0357  hypothetical protein  25.87 
 
 		 448 aa  50.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  24.19 
 
 		 1026 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.64 
 
 		 631 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  22.59 
 
 		 1068 aa  47.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  29.38 
 
 		 882 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  22.22 
 
 		 336 aa  45.8  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1002 aa  45.8  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.85 
 
 		 646 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0273  membrane protein-like protein  23.35 
 
 		 982 aa  45.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.57 
 
 		 702 aa  44.3  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1710  MMPL domain protein  21.7 
 
 		 1050 aa  43.9  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0991802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>