63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0989 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  630  1e-179  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  59.44 
 
 
317 aa  247  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  47.58 
 
 
242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  59.09 
 
 
217 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  59.09 
 
 
222 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0259926 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  38.04 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  33.33 
 
 
284 aa  155  8e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  36.96 
 
 
297 aa  155  9e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  35.85 
 
 
342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  40.49 
 
 
219 aa  151  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  43.68 
 
 
305 aa  144  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  34.06 
 
 
270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0222  hypothetical protein  38.67 
 
 
327 aa  139  7.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2328  hypothetical protein  35.62 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1429  hypothetical protein  51.72 
 
 
124 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.220825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0534  hypothetical protein  30.48 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0991  hypothetical protein  36.04 
 
 
241 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.95618  normal  0.04449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1907  paREP7  40.48 
 
 
303 aa  105  8e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000000796589  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4195  Protein of unknown function DUF1626  31.51 
 
 
274 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4234  Protein of unknown function DUF1626  31.51 
 
 
274 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713655 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0437  hypothetical protein  36.16 
 
 
247 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2960  Protein of unknown function DUF1626  33.7 
 
 
233 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1627  hypothetical protein  34.71 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00194583  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1071  hypothetical protein  34.13 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1977  hypothetical protein  34.59 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.529646  hitchhiker  0.0000143313 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1072  hypothetical protein  31.91 
 
 
323 aa  94  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.304238  normal  0.0380408 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1976  hypothetical protein  31.78 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000586901 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1477  hypothetical protein  40.71 
 
 
224 aa  86.7  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.206877  normal  0.225419 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0452  hypothetical protein  41.1 
 
 
219 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0737  Protein of unknown function DUF1626  40.41 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000438836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2227  hypothetical protein  33.92 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3381  hypothetical protein  29.65 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1375  hypothetical protein  38.53 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  28.26 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  27.19 
 
 
324 aa  63.9  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  28.65 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3269  low complexity protein, contains internal repeats QQVlQQDVAQLQAG  24.1 
 
 
198 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1148  hypothetical protein  29.95 
 
 
220 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0283624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3277  hypothetical protein  27.68 
 
 
217 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1685  hypothetical protein  28.38 
 
 
386 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000183285  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1392  2 domain protein  30.39 
 
 
252 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1426  hypothetical protein  30.39 
 
 
252 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1705  hypothetical protein  26.25 
 
 
271 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  23.03 
 
 
915 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0574  hypothetical protein  29.81 
 
 
209 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  25.58 
 
 
882 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.66 
 
 
769 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0285  hypothetical protein  30.25 
 
 
193 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000769793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4507  hypothetical protein  39.51 
 
 
136 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0809349  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  22.68 
 
 
772 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0460  hypothetical protein  34.57 
 
 
212 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0621  hypothetical protein  35 
 
 
292 aa  47  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149956  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  28.66 
 
 
1132 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1276  hypothetical protein  38.1 
 
 
244 aa  46.2  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.160585 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2563  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2036  hypothetical protein  42.86 
 
 
244 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  19.77 
 
 
923 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  27.39 
 
 
1132 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  18.29 
 
 
924 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1695  paREP7  35.35 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  21.55 
 
 
678 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2314  conserved hypothetical protein  23.17 
 
 
288 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.856278  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1156  hypothetical protein  36.14 
 
 
149 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>